Doktor Dolittle zostaje nowym dyrektorem cyrku, obejmując stanowisko po panu Blossomie, który uciekł z cyrku ze wszystkimi zarobionymi przez instytucję pieniędzmi. Mimo przeciwności cyrk funkcjonuje coraz lepiej. . Podczas pobytu w jednym z miasteczek doktor kupuje zieloną kanarzycę, która śpiewa mu pieśń przedstawiającą historię jej życia. Doktor wpada zatem na pomysł wystawienia opery przedstawiającej losy kanarzycy, w której śpiewakami i tancerzami miałyby być ptaki.
Wraz ze swoim cyrkiem doktor udaje się niezwłocznie do Londynu, gdzie rozpoczyna poszukiwania skrzydlatych aktorów do ptasiej opery.