Um dos objectivos importantes da terapia endodôntica é a obturação do sistema de canais radiculares preparado com um material inerte, dimensionalmente estável e biologicamente compatível. A guta-percha é universalmente aceite como o "padrão de ouro" dos materiais obturadores, mas não apresenta adesividade à estrutura dentária. O selante do canal radicular, por outro lado, preenche o espaço intermédio entre o material do núcleo e a parede da dentina. Um cimento endodôntico ideal deve proporcionar o seguinte: uma excelente vedação quando assente, estabilidade dimensional, um tempo de presa lento para assegurar um tempo de trabalho suficiente, insolubilidade aos fluidos tecidulares, adesão adequada às paredes do canal e biocompatibilidade. Estão disponíveis vários tipos de selantes, como selantes de resina, selante de agregado de trióxido mineral, selantes que contêm bio-cerâmica, selantes ZOE, selante que contém ionómero de vidro, selante que contém hidróxido de cálcio, etc. A escolha do selante depende do material do núcleo e da técnica de obturação, que dependerá ainda da anatomia do canal radicular e que também se diz ser afetada pelas condições periapicais pré-existentes para um resultado de cicatrização adequado.